PayPal is een relatief dure betaalmethode voor verkopers. PayPal rekent namelijk een percentage van 3,4% + vaste kosten van €0,35 per transactie. De kosten zijn wel afhankelijk van de omzet en het soort organisatie. Zo zijn de kosten voor een non-profit organisatie bijvoorbeeld lager. Meer informatie over de kosten lees je op de website van PayPal

Indien je gebruik maakt van de PayPal-koppeling via Mollie, betaal je hier €0,10 per transactie voor. Het voordeel van de koppeling is dat de PayPal-transacties op deze manier in het transactieoverzicht bij Mollie terechtkomen. Je kunt hierdoor via Mollie zien of er betaald is. Ook kan je door de koppeling de transacties via alle betaalmethodes in één keer exporteren voor je boekhouding.

Helaas staat PayPal niet toe dat een derde partij betalingen collecteert en uitbetaalt. Je ontvangt de uitbetaling van transacties via deze betaalmethode dus niet van Mollie, maar van PayPal. Het gebruik van de technische koppeling via Mollie is optioneel. Je kunt ook een rechtstreekse koppeling met PayPal maken. In dit geval bespaar je dus €0,10 per transactie, maar moet je wel twee verschillende exports verwerken in je boekhouding.